在進行細孔放電加工時，首先要依據孔徑的大小，選擇好對應的電極管，然后將電極管以及密封圈裝在機頭上。具體操作時要將工件放在工作臺，擺正位置，然后控制好機頭與工作面的距離。在加工完成之后，要注意觀察是否有遺漏，是否有不通的孔。

放電加工要格外注意細節，細節稍有松懈，就容易出現各種問題。要注意電極管工作時要保持垂直，一定不能彎曲。工件在工作臺上要注意保持好平衡讀，否則孔徑會有偏差。操作時如果機器出現了問題，一定不要盲目拆卸，一定要找專業對口的真正專家維修。

另外要注意機器的保養，要注意聽機器的聲音，確保沒有異響。檢查馬達的皮帶，看是否松動，機器的滑塊等部位要注意及時打油，注意檢查水泵是否正常工作，細節方面一定不能馬虎。

細孔放電加工的電源有要求，必須是三相電源，在使用的時候，一定要注意電流輸入情況，不能欠相，否則電壓不穩，加工效率會大幅度下降。

加工的環境也要注意，一定要保持環境的整潔，不能有太過駁雜的氣體，比如腐蝕性的化學氣味，也不能有灰塵以及濕氣一類，這些都會對放電加工造成干擾。